消化爐在蛋白質檢測中起到了很重要的作用，選擇一臺合適的消化爐是準確檢測的前提。在選購消化爐時需要注意六點。
1、消化爐溫度要恒定，波動要小，每個樣品可以有一致的消化時間，
2、每一個樣品孔溫度要一致，以免樣品消化時間相差太大。
3、能有效的控制溫度變化的過程，以免消化時的樣品掛壁。如果有程序升溫控制就能有效達到所需。
4、有效地保溫措施，以提高爐腔內溫度的恒定性，如果保溫材料勢單力薄，必造成溫度不穩定。儀器較厚的保溫層是溫度穩定的需要。故保溫材料的厚度和材質是一個重要的指標。
5、加熱體和熱載體的選擇，可以根據用戶的需要選擇不同的熱載體。下面我們來討論加熱體和熱載體的選擇。
現在加熱主要有三種方式：
（1）紅外加熱，靠熱輻射來加熱樣品。特點是：升溫快，熱慣性小，溫控準確。一般應用于有高要求樣品的消化。例如：有較快的升溫和降溫速度。程序升溫可以使用戶更具自己樣品的特點來選擇升溫曲線，或選擇分段式的升溫，更有利益樣品的消化，從而杜絕樣品的掛壁現象、進而使得樣品消化效率的大大提高
（2）鋁錠加熱，靠鋁錠傳導熱給樣品。特點：升溫較慢，熱慣性較大，溫度較穩定，還由于鋁錠的良好的熱傳導性，每個樣品孔間的溫度一致性好。廣泛應用于消化爐的熱載體，但也要注意：一片薄薄的鋁錠也不能保持溫度的恒定，所以選擇鋁錠消化爐，鋁錠厚度也是一個考察指標。
（3）石墨加熱，靠石墨傳導給樣品熱量。特點：熱慣性大升溫較慢，由于石墨熱傳導性較差(相比較鋁錠)，使得樣品孔間溫度不均勻，容易造成樣品間消化時間拉大。但是由于石墨成本較低，石墨消化爐成本便宜，對部分低端用戶有一定的吸引力。
6、注意消化爐安全的保護功能：溫度穩定保護，過流和短路保護。
